بعضی از اصلی ترین مشکلات استقرار سیستم کنترل مدارک و مستندات کیفیت در سازمانها عبارتند از :* بالا بردن شدید کاغذ بازی و بوروکراسی در سازمانها
* عدم انعطاف مناسب در مواقعی که تغییرات سازمانی بوجود می آید (مانند ادغام چند واحد و یا ایجاد یک واحد جدید)بطوریکه انبوهی از مدارک باید منسوخ شده و تعداد...