صفحه 3 از 5 نخستنخست 12345 آخرينآخرين
نمايش نتايج 21 تا 30 از 41

تاپیک: نشانگرهای مولکولی

  1. #21
    عضو فعال آواتار sun_girl
    رشته
    مهندسی کشاورزی
    مقطع
    فوق لیسانس
    تاريخ عضويت
    2009/10
    امتیاز
    2427
    پست ها
    1,502

    پيش فرض نشانگرهای EST

    EST ها فقط ژنهاي بيان شده را نشان مي دهند. يك EST توالي ساده از يك همسانه cDNA است كه با يك مولكول mRNA يا بخشي از آن تطابق دارد. ESTهايي با طول 150-400جفت باز براي بررسي تشابه و مكان يابي مفيد هستند. همچنين EST ها را مي توان با توالي هاي موجود در بانك اطلاعاتي ژن ها و پروتئين ها مطابقت داد و به كمك نرم افزارها و برنامه هاي مختلف كامپيوتري ژنهاي مشابه آنها را پيدا كرد.
    سلام

    [مشاهده ی لینک ها فقط برای اعضا امکان پذیر است. ]

  2. تشكرها از اين پست


  3. #22
    عضو فعال آواتار sun_girl
    رشته
    مهندسی کشاورزی
    مقطع
    فوق لیسانس
    تاريخ عضويت
    2009/10
    امتیاز
    2427
    پست ها
    1,502

    پيش فرض نشانگرهای SNP

    SNP ها چند شكلي مبتني بر تفاوت در يك نوكلئوتيد ( جايگزيني، حذف يا الحاق ) هستند كه در ژنوم فراواني بالايي دارند. اين نشانگرها اطلاعات كمتري نسبت به ساير نشانگرهاي چند آللي نظير ريزماهواره ها دارند. ولي فراواني بالاي آنها در ژنوم، باعث برتري SNP ها نسبت به ساير نشانگرها شده است.
    سلام

    [مشاهده ی لینک ها فقط برای اعضا امکان پذیر است. ]

  4. تشكرها از اين پست


  5. #23
    عضو فعال آواتار sun_girl
    رشته
    مهندسی کشاورزی
    مقطع
    فوق لیسانس
    تاريخ عضويت
    2009/10
    امتیاز
    2427
    پست ها
    1,502

    پيش فرض نشانگرهای ریزماهواره


    ريزماهواره‌ها قطعات كوتاهي از DNA هستند كه در آنها اشكال خاصي از توالي‌هاي 6-1 جفت باز به صورت تكراري و به دفعات زياد پشت سر هم قرار گرفته‌اند. حداكثر طول اين قطعات تكراري 100-60 جفت باز است. ريزماهواره‌ها تحت عناوين توالي‌هاي كوتاه تكراريSTRيا توالي‌هاي ساده تكراري SSRنيز شناخته مي‌شوند. اين مكانهاي ژني از تنوع ژني بالايي برخوردار بوده و از 1 تا 27 آلل در هر لوكوس تكثير مي كنند. اختصاصي هستند و همولوژي بالايي بين آنها وجود ندارد. ريزماهواره ها مي توانند به علت ميزان موتاسيون بالا در DNA تكراري، نشانگرهاي اختصاصي توليد كنند. ريز ماهواره ها به صورت همبارز به نتاج منتقل مي شوند.
    سلام

    [مشاهده ی لینک ها فقط برای اعضا امکان پذیر است. ]

  6. تشكرها از اين پست


  7. #24
    عضو فعال آواتار sun_girl
    رشته
    مهندسی کشاورزی
    مقطع
    فوق لیسانس
    تاريخ عضويت
    2009/10
    امتیاز
    2427
    پست ها
    1,502

    پيش فرض نشانگرهای ریزماهواره

    توالی تکراری ساده ریزماهواره(SSR) یک توالی تکراری DNA می باشد که عموماً شامل واحد 1-6 نوکلئوتیدی است. بعلت توانایی بالای SSR در نشان دادن پلی مورفیسم، توارث همبارز و فراوانی نسبی در ژنوم از این نشانگرها برای آنالیزهای ژنتیکی استفاده می شود. نشانگرهایSSR این امکان را بوجود می آورند که آلل های نمونه های مختلف به طور مستقیم مورد مقایسه قرار گیرند و به نتایج سایر گروه های تحقیقاتی ارتباط داده شوند. در مجموع شناسایی و آنالیز آلل هایSSR بدلیل طبیعت همبارز آنها آسان و سودمند است. بنابراین نشانگرهای SSR برای مطالعات رده بندی، بررسی تنوع ژنتیکی و ترکیب نقشه های لینکاژی گونه های مختلف مناسب است.

    علی رغم اینکه تعداد زیادی از این توالی ها گزارش شده اما هنوز مطالعات در این زمینه تکمیل نشده است. این موضوع از اهمیت زیادی برخوردار است زیرا مطالعه تکامل این نشانگرها به پیش از کاربرد آنها برمی گردد. بررسی الگو های تکامل مولکولی و مکانیسم های جهشی به توالی یابی آلل های ریزماهواره نیاز دارند. بدون داشتن دانش کافی در این زمینه پتانسیل کافی برای استفاده از آنها را نخواهیم داشت و نقش آنها در مطالعات ژنتیکی جمعیتی کلیشه ای خواهد شد. مطالعات ژنتیک جمعیت در سال های اخیر با به کارگیری تکنیکPCR و معرفی نشانگرهای ریزماهواره و DNAمیتوکندریایی بسیار سودمند و مورد توجه قرار گرفته است. نشانگرهایDNA میتوکندریایی ابزار توانمندی در مطالعات بررسی تکامل در جمعیت های جانوری می باشند و توالی های ریزماهواره نشانگرهای مهمی در بررسی ساختار جمعیت و پویایی آن می باشند. برای آنالیزهای درون گونه ای نشانگرهای ریزماهواره بیش از نشانگرهای میتوکندریایی و سایر نشانگرهای رایج مورد استفاده قرار می گیرند. این توالی های ساده تکراری در سراسر ارگانیسم های یوکاریوت ها پراکنده شده اند و از سطح بالایی از پلی  مورفیسم برخوردار می باشند. از قوانین وراثت مندلی و تکامل ظاهری ساده ای تبعیت می کنند.

    گرایش به استفاده از ریزماهواره ها در سال های اخیر بطور قابل ملاحظه ای رو به افزایش می باشد بطوری که فقط در فاصله سال های 2000- 1995، بالغ بر 8000 ریزماهواره شناسایی و جداسازی شدند
    سلام

    [مشاهده ی لینک ها فقط برای اعضا امکان پذیر است. ]

  8. تشكرها از اين پست


  9. #25
    عضو فعال آواتار sun_girl
    رشته
    مهندسی کشاورزی
    مقطع
    فوق لیسانس
    تاريخ عضويت
    2009/10
    امتیاز
    2427
    پست ها
    1,502

    پيش فرض مزایای ریزماهواره ها

    پلی مورفیسم بالا و آسانی نسبی در اسکوربندی و تجزیه داده های حاصل، از ویژگی های مهم نشانگرهای ریزماهواره است که موجب توسعه مطالعات آن شده است (Zane, 2002). گذشته از این ریزماهواره ها درجه بالایی از انتقال پذیری میان گونه ها را نشان داده اند. همبارز بودن و پراکنش ریزماهواره ها در تمام ژنوم از دیگر مزایای مهم این نشانگرها می باشد. از آنجا که برای یک جایگاه که آغازگر ریزماهواره بر اساس آن طراحی می شود، آلل های متعددی یافت می شود، این نشانگر برای بررسی تنوع ژنتیکی قابلیت بالایی دارد (Jewell, 2006).
    سلام

    [مشاهده ی لینک ها فقط برای اعضا امکان پذیر است. ]

  10. تشكرها از اين پست


  11. #26
    عضو فعال آواتار sun_girl
    رشته
    مهندسی کشاورزی
    مقطع
    فوق لیسانس
    تاريخ عضويت
    2009/10
    امتیاز
    2427
    پست ها
    1,502

    پيش فرض فراواني و توزيع ريزماهواره‌ها در ژنوم

    ریزماهواره ها توالی های کوتاه تکراری هستند که در ژنوم تمام پروکاریوت ها و یوکاریوت ها وجود دارند. آنها در هر دو ناحیه کد کننده و غیر کد کننده وجود دارند و معمولاً با درجه بالایی از پلی مورفیسم مشخص می شوند (Zane, 2002).
    پایداری ریزماهواره ها احتمالاً از طریق پایداری ژنوم در کلیه سطوح کنترل می شود، بطوری که برخی جهش ها نظیر جهش هایی که موجب عدم ترمیم DNA می شوند، می توانند پایداری ژنوم و در نتیجه ریزماهواره ها را تحت تأثیر قرار دهند (Jewell, 2006).
    سلام

    [مشاهده ی لینک ها فقط برای اعضا امکان پذیر است. ]

  12. تشكرها از اين پست


  13. #27
    عضو فعال آواتار sun_girl
    رشته
    مهندسی کشاورزی
    مقطع
    فوق لیسانس
    تاريخ عضويت
    2009/10
    امتیاز
    2427
    پست ها
    1,502

    پيش فرض جايگاه ژنومي ريزماهواره‌ها

    ژنوم بیشتر ارگانیسم ها شامل سه دسته از توالی های تکراری DNA می باشند که بر اساس اندازه عبارتند از : ماهواره ها، ماهوارک ها و ریزماهواره ها.
    ریزماهواره ها کوچکترین توالی های تکراری می باشند. برخی محققین اندازه ریزماهواره ها را bp 2-8 عنوان کرده اند، برخی دیگر bp 1-6 و برخی bp1-5. چامبر و مکاووی در سال 2000 برbp 2-6 تأکید داشتند(Semagn et al., 2006).
    سلام

    [مشاهده ی لینک ها فقط برای اعضا امکان پذیر است. ]

  14. تشكرها از اين پست


  15. #28
    عضو فعال آواتار sun_girl
    رشته
    مهندسی کشاورزی
    مقطع
    فوق لیسانس
    تاريخ عضويت
    2009/10
    امتیاز
    2427
    پست ها
    1,502

    پيش فرض پيدايش ريزماهواره‌ها

    عوامل مؤثر بر پديد آمدن و توزيع ريزماهواره‌ها بر روي ژنوم به خوبي شناخته نشده‌اند ولي اخيراً دو فرضيه براي بوجود آمدن اين رده از DNA ‌هاي تكراري ارايه شده است.

    الحاق و جايگزيني نوكلئوتيدها
    اساس اين فرضيه بر جهش‌هاي نقطه‌اي الحاقي و جايگزيني استوار است (شكل2-2). به دليل اينكه جايگزيني‌ها خيلي متداول‌تر از الحاق‌ها هستند بنابراين گمان مي‌رود كه جايگزيني‌ها منبع ‌اصلي ريزماهواره‌هاي دو بازي ‌باشند.

    وقوع جهش‌هايي از نوع الحاقي نادرتر است ولي بيش از 70 درصد جهش‌هاي الحاقي 4-2 بازي باعث مضاعف شدن توالي‌هاي مجاور نقطه جهش مي‌شوند و بيش از نيمي از اين‌ها مناطق جديد تكراري را بوجود مي‌آورند. سهم الحاق‌ها در مكان‌هاي ژني جديد تكراري كمتر از جايگزيني‌ها است ولي اهميت نسبي آنها با افزايش تعداد تكرارها افزايش مي‌يابد. به طوري كه مي‌توان گفت مراحل مضاعف شدن تكرارها، در بوجود آمدن ريزماهواره‌هاي با واحدهاي بزرگتر، سهم بيشتري دارند .(Goldsteine, 1998)

    عناصر متحرك و بوجود آمدن ريزماهواره‌ها
    اساس اين فرضيه بر تحرك رتروپوزون‌هايي است كه هسته مركزي آنها داراي توالي‌هاي پيش ريزماهواره است. از عمده‌ترين اين عناصر متحرك مي‌توان به عناصر mini-mi اشاره كرد. اين عناصر به طور گسترده‌اي در تمام ژنوم‌هاي يوكاريوتي يافت مي‌شوند و تخمين زده شده است كه حدود 2/1 درصد از ژنوم مگس سركه را تشكيل مي‌دهند. اين مسئله نشان‌دهنده استعداد زياد اين عناصر به عنوان منبع ريزماهواره‌ها است. وجود توالي‌هاي معكوس در دو انتهاي اين عناصر و وجود يك ناحيه مضاعف شده در انتهاي ¢5 اين عناصر باعث ايجاد يك ساختمان سنجاق‌سري مي‌شود كه بالقوه مي‌تواند ساختار يك ريزماهواره را بوجود آورد.(Goldsteine, 1998)

    سلام

    [مشاهده ی لینک ها فقط برای اعضا امکان پذیر است. ]

  16. تشكرها از اين پست


  17. #29
    عضو فعال آواتار sun_girl
    رشته
    مهندسی کشاورزی
    مقطع
    فوق لیسانس
    تاريخ عضويت
    2009/10
    امتیاز
    2427
    پست ها
    1,502

    پيش فرض چندشكلي ريزماهواره‌ها

    اساس پلی مورفیسم در ریزماهواره ها هنوز کاملاً شناسایی نشده است، هر چند به نظر می رسد به احتمال زیاد بعلت پدیده لغزش در هنگام رونویسی DNAباشد (Zane, 2002).
    پلی مورفیسمی در ریزماهواره ها بعلت جهش در تعداد واحدهای تکراری بسیار بالا می باشد (Jewell, 2006) .
    تنوع تعداد واحدهاي تكرار شونده در ريزماهواره‌ها خود ناشي از نرخ جهش در اين نشانگرهاست. اين ميزان جهش در مقايسه با نرخ جهش نقطه‌اي بسيار بالاست (9-10 تا 10-10). بررسي‌هاي شجره اي در انسان نرخي حدود 3-10 جهش در هر جايگاه در هر نسل را نشان داده است ولي اين نرخ در مگس سركه نسبتاً پايين و حدود 6-10 ×6 مي‌باشد .(Goldsteine, 1998)
    سلام

    [مشاهده ی لینک ها فقط برای اعضا امکان پذیر است. ]

  18. تشكرها از اين پست


  19. #30
    عضو فعال آواتار sun_girl
    رشته
    مهندسی کشاورزی
    مقطع
    فوق لیسانس
    تاريخ عضويت
    2009/10
    امتیاز
    2427
    پست ها
    1,502

    پيش فرض منشاء ريزماهواره

    فرض مي‌شود كه پيش ريزماهواره كوتاه به‌طور تصادفي ايجاد مي‌شود. اخيراً در يك بررسي نتيجه‌گيري شده است كه بسط طول ژنومي ريزماهواره‌اي به يك حداقل تعداد تكرار نياز دارد. تحقيقي در مخمر نشان داد كه بسط ريزماهواره به حداقل تعداد تكرار نياز دارند. بعضي نتايج بدست آمده از مقايسه بين گونه‌اي تائيد مي‌كند كه ريزماهواره‌ها كوتاه‌تر از دو تكرار نيز در طولشان تغيير مي‌كنند. بنابراين ريزماهواره‌ها مي‌توانند بوسيله جهش‌هاي نقطه‌اي تصادفي كه بوسيله لغزش در همانندسازي ايجاد مي‌شود (كه توزيع و بسط پيش ريزماهواره كوتاه را ايجاد مي‌كند)، بوجود آيند(Schloterer, 2000).
    ارتباط تکامل در میان آلل های ریزماهواره ها پیچیده می باشد. تفاوت اندازه آلل ها با تفکیک و انشعاب آنها از همدیگر بطور مستقیم ارتباطی ندارد. این فرض که همه تفاوت ها منجر به تغییرات تعداد کپی ها می شوند نیاز به تحقیقات بیشتری دارد. تشابه ساختمانی فراوانی مشاهده شده گویای این امر است که تفاوت آلل ها می تواند هم بوسیله تنوع شمار تکرارها و هم تنوع پایه ای در مناطق پهلویی ایجاد شود (Zhangh, 2003).
    سلام

    [مشاهده ی لینک ها فقط برای اعضا امکان پذیر است. ]

  20. تشكرها از اين پست


صفحه 3 از 5 نخستنخست 12345 آخرينآخرين

تاپیک های مشابه

  1. پاسخ ها: 0
    آخرین ارسال: 2011/3/25, 12:13 AM
  2. پاسخ ها: 0
    آخرین ارسال: 2010/10/10, 10:34 AM
  3. ضریب نفوذ مولکولی انتقال جرم
    توسط alireza685 در تالار مهندسی پلیمر
    پاسخ ها: 0
    آخرین ارسال: 2010/2/14, 05:07 PM
  4. ابداع سوئیچهای مولکولی نوری که موجودات زنده را فلج می کند
    توسط silenta در تالار زیست سلولی و مولکولی
    پاسخ ها: 0
    آخرین ارسال: 2009/11/22, 04:56 PM
  5. پاسخ ها: 0
    آخرین ارسال: 2009/3/27, 09:19 PM

عبارت‌های مرتبط

دانلود کتاب نشانگرهای مولکولی

نشانگرهای مولکولی

انواع نشانگر مولکولی

برچسب های اين تاپیک

ثبت اين صفحه

ثبت اين صفحه

قوانين ارسال

  • شما نمی‌توانيد تاپيک جديد ارسال كنيد
  • شما نمی‌توانيد پاسخ ارسال كنيد
  • شما نمی‌توانید فایل ضمیمه ارسال كنيد
  • شما نمی‌توانيدنوشته‌های خود را ويرايش كنيد
  •